MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia canadensis str. McKiel

Total Repeats: 8010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009879	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009879	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009879	TGT	2	6	878	883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009879	A	6	6	897	902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009879	CAG	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009879	TAAATT	2	12	955	966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009879	AAT	2	6	1016	1021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009879	AT	3	6	1020	1025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009879	TTC	2	6	2179	2184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009879	TGT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009879	TCC	3	9	2227	2235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009879	TTA	2	6	2249	2254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009879	AGT	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009879	AAC	2	6	6256	6261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009879	AT	3	6	6324	6329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009879	TGG	3	9	8617	8625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009879	ATA	2	6	8696	8701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009879	AGAA	2	8	8746	8753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009879	AT	3	6	8772	8777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009879	ATTT	2	8	8844	8851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009879	GTT	2	6	8859	8864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009879	TTTTAT	2	12	9862	9873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009879	AT	4	8	9875	9882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009879	TAAG	2	8	9894	9901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009879	AAT	2	6	9907	9912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009879	TAAT	2	8	9915	9922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009879	GTT	2	6	9971	9976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009879	TAG	2	6	10017	10022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009879	TCT	2	6	10099	10104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009879	A	6	6	10105	10110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009879	TAAA	2	8	10112	10119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009879	TAAA	2	8	10139	10146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009879	TA	4	8	10162	10169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009879	TA	3	6	10239	10244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009879	GAA	2	6	10249	10254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009879	T	6	6	10338	10343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009879	AGAA	2	8	10349	10356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009879	T	6	6	10365	10370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009879	AGATA	2	10	10371	10380	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009879	AT	3	6	10389	10394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009879	T	6	6	10402	10407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009879	A	6	6	10446	10451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009879	AT	3	6	13022	13027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009879	ATT	2	6	13063	13068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009879	TAAT	2	8	13083	13090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009879	A	7	7	13281	13287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009879	A	7	7	13295	13301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009879	GCA	2	6	13363	13368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009879	ATT	2	6	13370	13375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009879	TA	3	6	13405	13410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009879	AAGC	2	8	13446	13453	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009879	A	6	6	13463	13468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009879	AGTA	2	8	13490	13497	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009879	GAA	2	6	13506	13511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009879	TAC	2	6	13521	13526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009879	ATG	2	6	13537	13542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009879	AATA	2	8	13559	13566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009879	TAAG	2	8	13634	13641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009879	TTC	2	6	13643	13648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009879	AT	3	6	13706	13711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009879	TAT	2	6	13725	13730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009879	TG	3	6	14054	14059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009879	TAC	2	6	14095	14100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009879	CTA	2	6	14120	14125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009879	T	6	6	14166	14171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009879	ATT	2	6	14182	14187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009879	TAC	2	6	14191	14196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009879	TCC	2	6	14200	14205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009879	ATT	2	6	14251	14256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009879	ATT	2	6	14483	14488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009879	CTT	2	6	14497	14502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009879	T	6	6	14506	14511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009879	TA	3	6	14551	14556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009879	ATA	2	6	14567	14572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009879	AAT	2	6	14578	14583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009879	AT	3	6	14621	14626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009879	TTAT	2	8	14646	14653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009879	TAAT	2	8	14683	14690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009879	TA	3	6	19191	19196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009879	ACC	2	6	19299	19304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_009879	ATT	2	6	19373	19378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009879	TAA	2	6	19383	19388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009879	TTA	2	6	19389	19394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009879	AAT	2	6	19399	19404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009879	A	7	7	19437	19443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009879	ATA	2	6	19457	19462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009879	TAA	2	6	19471	19476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009879	A	6	6	19490	19495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009879	TAA	2	6	19540	19545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009879	T	7	7	19580	19586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009879	ATCT	2	8	19620	19627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009879	ATT	2	6	19695	19700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009879	A	7	7	20293	20299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009879	ATA	2	6	20303	20308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009879	AAG	2	6	20359	20364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009879	ATA	2	6	20382	20387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009879	AGT	2	6	20397	20402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009879	TA	3	6	20486	20491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009879	CCT	2	6	20512	20517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_009879	TTA	2	6	20534	20539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009879	A	6	6	20545	20550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009879	TAA	2	6	20587	20592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009879	GCTA	2	8	20625	20632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009879	AGA	2	6	20648	20653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009879	GAA	2	6	20657	20662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009879	TTA	2	6	20674	20679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009879	GAA	2	6	20762	20767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009879	ATA	2	6	20771	20776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009879	ATT	2	6	20839	20844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009879	TA	3	6	20870	20875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009879	AT	3	6	20909	20914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009879	AAT	2	6	20935	20940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009879	TAC	2	6	20941	20946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009879	ATA	2	6	20952	20957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009879	TGA	2	6	20965	20970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009879	GA	3	6	21018	21023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009879	TAA	2	6	21046	21051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009879	TTA	2	6	21065	21070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009879	GTG	2	6	21078	21083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009879	ATT	2	6	21109	21114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009879	T	8	8	21174	21181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009879	AAT	2	6	21206	21211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009879	GAA	2	6	21260	21265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009879	A	6	6	21281	21286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009879	ATA	2	6	21349	21354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009879	AAG	2	6	21358	21363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009879	TAA	2	6	21393	21398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009879	TTA	2	6	21405	21410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009879	ATT	2	6	21437	21442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009879	AAT	2	6	21491	21496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009879	TAT	2	6	21513	21518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009879	A	7	7	21567	21573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009879	TGT	2	6	21589	21594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009879	AGT	2	6	21608	21613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009879	TGT	2	6	21724	21729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009879	TAA	2	6	21766	21771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009879	ACA	2	6	21817	21822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009879	TAG	2	6	21897	21902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009879	TTAA	2	8	23127	23134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009879	CTT	2	6	23147	23152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009879	AG	3	6	23166	23171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009879	AAG	2	6	23280	23285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009879	CGT	2	6	24322	24327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_009879	CTT	2	6	24390	24395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_009879	TTTA	2	8	25308	25315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009879	TAA	2	6	25361	25366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009879	ATA	2	6	25389	25394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_009879	TTG	2	6	26000	26005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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